Eine Art ist funktional oder funktionell ausgestorben, wenn nicht mehr genügend Individuen vorhanden sind, um neue Generationen hervorzubringen. Ist die Population einer Art sehr klein und die Individuen pflanzen sich untereinander fort (Inzucht), erleidet die Art meist einen Fitnessverlust und ist nicht mehr lebensfähig. Funktional ausgestorben bedeutet auch, dass die Art keine wesentliche Rolle mehr für die Funktion des Ökosystems spielt.
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